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La préséniline1 (PS1) lorsqu’elle est mutée, cause la maladie d’Alzheimer sous forme héréditaire. Cette protéine est impliquée dans diverses voies de signalisation, particulièrement la voie de Notch et de la protéine précurseur de l’amyloïde (APP). L’objectif de ce travail était d’étudier la relation entre ces deux voies. Pour ce faire, nous voulions créer une banque d’ADNc à partir de cellules qui surexpriment une portion du gène Notch pour ensuite la cribler par la méthode du double hybride de levure. Malheureusement, nous n’avons pu créer la banque d’ADNc. Cependant nous avons criblé une banque commerciale d’ADNc de cerveau embryonnaire humain en utilisant les sondes constituées par le domaine N-terminal de PS1 (1-132) ainsi que le domaine intracellulaire d’APP (AICD). Différents partenaires ont été identifiés avec les 2 sondes. Parmi ceux-çi, un clone ayant le potentiel de relier les voies de Notch et APP a été identifié avec la sonde AICD.
Mélissa Ferland Dr. Georges Lévesque
Tout au long de ces deux années, j’ai été entourée de personnes extraordinaires qui m’ont permit de réaliser ma maîtrise dans une ambiance de travail très agréable.
J’aimerais particulièrement remercier mon directeur de recherche Dr. Georges Lévesque qui m’a accepté au sein de son équipe. Je lui dis également merci pour sa patience, son écoute, son support et sa disponibilité pour répondre à nos questions et chercher avec nous des solutions à nos problèmes.
L’ambiance du laboratoire fut des plus agréable grâce à mes coéquipiers Chantal Godin (l’assistante de recherche) et Sébastien Hébert (étudiant au doctorat) ainsi que; Christian, Jacqueline, Jean-Sébastien, Marc-Étienne et Nathalie qui partagent le même laboratoire que nous. Leurs diverses connaissances et expériences dans le domaine m’ont permis d’apprendre énormément et surtout de me simplifier la vie à plusieurs occasions.
Je remercie le Dr. Madeleine Carreau et son équipe de laboratoire (Cédric, Marie-Chantal, Isabelle) qui à de nombreuses reprises ont répondu à mes questions et sur qui je pouvais compter si par mégarde une solution quelconque manquait.
Merci à Richard Rhéel pour sa bonne humeur et d’être toujours près à nous aider lorsqu’un problème technique surgit.
Finalement, je veux particulièrement remercier mon copain Dany ainsi que ma famille pour leurs encouragements et leur support tout au long de ma maîtrise.
α alpha
β beta
γ gamma
A adénine ou (désoxy) riboadénosine mono-, di ou triphosphate
-A moins l’acide aminé adénine
a.a acide aminé
βA β amyloïde
ADAM «a disintegrin and metalloproteinase» une désintégrine et métalloprotéinase
ADN acide désoxyribonucléique
ADNc acide désoxyribonucléique complémentaire
AICD domaine intracellulaire d’APP
ApoE4 apolipoprotéine E allèle ε4
APP protéine précurseur de l’amyloïde
APPβ fragment de la protéine précurseur de l’amyloïde obtenu par le clivage par la β-sécrétase
APPα fragment de la protéine précurseur de l’amyloïde obtenu par le clivage par la α-sécrétase
ARN acide ribonucléique
ARNm acide ribonucléique messager
BACE «B-APP cleaving enzyme» enzyme clivant APP
C cytosine ou (désoxy) ribocytidine mono-, di- ou triphosphate
ºC degré celcius
C83 ou C99 fragment C-terminal d’APP de 83 ou 99 acides aminés
C.elegans Caenorhabditis elegans
cfu colonies formant une unité
CO2 dioxyde de carbone
DMEM «Dulbecco’s Modified Eagle Medium» Milieu de culture Eagle de type Dulbecco
DMF diméthylformamide
dNTP désoxyribonucléotide triphosphate ou N = A, C, G, T
DTT dithiothréitol
E.coli Escherichia coli
EDTA tétraacétate de disodium et d’éthylènediamine
EGF «epidermal growth factor» facteur de croissance épidermal
FBS «fœtal bovine serum» sérum de veau foetal
FCT fragment carboxy-terminal
FNT fragment amino-terminal
G guanine ou (désoxy) riboguanosine mono-, di- ou triphosphate
G-418sulfate Geneticin™
GAPDH glycéraldéhyde-3-phosphate déhydrogénase
g/L gramme par litre
-H moins l’acide aminée histidine
HeBS «HEPES buffered saline» tampon salin à partir HEPES
HEK293T «Human embryonic kidney 293T» des cellules embryonnaires de reins humains
HEPES acide sulfonique n-2-hydroxyéthylpipérazine-n-2-éthane
HES «hairy and enhancer of split»
HRP «Horseradish peroxidase»
Kan kanamycine
Kb kilobase d’ADN ou ARN
KCl chlorure de potassium
kDa kiloDalton
-L moins l’acide amine leucine
lacZ gène de la β-galactosidase
LB Luria Bertani
LiAc acétate de lithium
LPR protéines reliées au récepteur des lipoprotéines faibles en densité
mA milliampère
MAH maladie d’Alzheimer sous forme héréditaire
MeOH méthanol
mg milligramme
MgCl2 chlorure de magnésium
MgSO4 sulfate de magnésium
ml millilitre
mmol millimolaire
NaCl chlorure de sodium
Na2HPO4 phosphate de sodium
NaH2PO4.7H2O phosphate de sodium monobasic
Nβ peptide de Notch ressemblant au fragment βA
Neuro2A Neuroblastome de souris
NICD domaine intracellulaire de Notch
Oligo-dT oligonucléotide composé de désoxythymidines
OPTI-MEM «modification of Eagle’s minimal essential medium» milieu modifié du milieu minimal essentiel de Eagle
pb paire de base d’ADN
PBS «phosphate buffered saline» tampon physiologique
PCR réaction de polymérisation en chaîne
PEG polyéthylène glycol
pH «power of hydrogen-power of the concentration of hydrogen ion» mesure de l’acidité ou de l’alcalinité d’une solution
PS1 préséniline 1
PS2 préséniline 2
p/v poids/volume
PVDF polyvinyldifluoride
RE réticulum endoplasmique
RNase ribonucléase
RT transcription inverse
SD «Synthetic Defined» solution avec du «dropout»
SDS dodécyl sulfate de sodium
SDS-PAGE SDS- «page polyacrylamide gel electrophoresis» gel d’électrophorèse de polyacrylamide
T thymine ou (désoxy) thymidine mono-, di- ou triphosphate
-T moins l’acide aminé tryptophane
TACE «tumor necrosis factor alpha converting enzyme»
TAE tris - acide acétique - EDTA
TBS «tris buffered saline» tampon tris avec NaCl
TBST TBS- tween
TE Tris-EDTA
TP température pièce
Tris hydroxyméthyl-aminométhane
Tween Polyoxyéthylène sorbitan monolaurate
U uracile ou uridin mono-, di-, ou triphosphate
μg microgramme
μl microlitre
μM micromolaire
UPR «unfolded protein response» réponse aux protéines mal repliées
U/μl unité par microlitre
UV ultraviolet
VIH virus d’immunodéficience humaine
v/v volume/volume
wt «wild type» ou type sauvage
X-gal 5-bromo-4-chloro-3-indolyl-β-D-galactopyranoside
YPAD milieu YPD(yeast extract-peptone-dextrose) avec de l’adénine